熱き魂《ソウルハート》の声が聞こえるか!?この夏一番のバトルがキミを待っている!!
旅をするサトシたちの前に、空から突然大きなポケモンが降ってきた!落下の衝撃で土煙が舞う中あらわれたのは、幻のポケモン・ボルケニオン。人里離れた「ネーベル高原」で、人間に傷つけられたポケモンたちと共に暮らすボルケニオンは、実は人間たちのことが大嫌い。
サトシたちをよそに急いで立ち去ろうとするボルケニオンだが、なぜかサトシまで一緒に引っ張られてしまう。駆け出すボルケニオンと引きずられるサトシ。
なんと二人は不思議な鎖で、いつの間にかつながってしまったのだ!これでは離れたくても離れられない。仕方なくボルケニオンは衝突してばかりのサトシを引きずりながら、「アゾット王国」を目指して走り始めた。
そこでは大臣のジャービスが人造ポケモン・マギアナに宿るといわれている未知の力「ソウルハート」を利用し、王国の支配をたくらんでいた。
アニメ声優初挑戦となる市川染五郎と松岡茉優がゲスト声優としてポケモンの世界に参加。